日本キリスト教団函館教会は、統一協会（統一原理）、エホバの証人（ものみの塔）、末日聖徒イエス・キリスト教会（モルモン教）とは一切関係がありません。正統的なキリスト教信仰に立つ教会です。その中でも、東方教会（ギリシャ正教やロシア正教など）に対して、西方教会に所属します。さらに、その西方教会のうち、ローマカトリック教会から、１６世紀に分かれた福音主義（プロテスタント）教会です。どなたでも礼拝に出席できますので、どうぞお出かけください。